Le génome du grand Goldwyn de Semex séquencé
Des scientifiques de l’Université de l’Alberta viennent d'achever le séquençage du génome du grand taureau Semex, Braedale Goldwyn. Il est ainsi le premier taureau au Canada dont le génome a été séquencé.
Cette opération nécessite de déterminer l’ordre et la nature de toutes les molécules d’ADN comprises dans les chromosomes d’un individu. Le génome bovin comporte 3 millions de molécules d’ADN. On peut considérer le séquençage comme l’opération ultime du génotypage. Au lieu de ne caractériser que 50.000 molécules d’ADN dans le génome d’un individu, tel qu’on le fait avec le panel de 50.000 dans la sélection génomique, le séquençage du génome caractérise les 3 milliards de molécules.
Dans le cadre d’un partenariat avec Life Technologies, les docteurs Stephen Moore et Paul Stothard de l’Université de l’Alberta, ont établie la séquence du génome de Goldwyn avec une couverture 20X en moins de trois coups sur le SOLiD 3 System.
« L’utilisation de ces renseignements supplémentaires apporte de la clarté sur la valeur d'un animal, comme un plan détaillé de la constitution génétique d’un individu », explique le docteur Moore, chef du programme de génomique bovine à l’Université de l’Alberta. « Scientifiquement, ceci représente la prochaine vaque de génomique. »
Avec la baisse continue des coûts de séquençage, il va être possible à l'avenir d'établir la séquence du génome de la plupart des animaux. Ces information, couplées avec les mesure phénotypiques appropriées sur un grand nombre d’animaux de ferme, permettra aux éleveurs d'être mieux avertis en matière de décisions. Le fait de savoir quel gènes contribuent à certains caractères intéressants ouvrira des portes au niveau d’autres secteurs, tel que la santé et les maladies des humains.
« Maintenant que nous avons la séquence du génome de ce taureau d’élite (Goldwyn), notre équipe va pouvoir étudier les variations qui le caractérisent et suivre leur transmission au cours des générations suivantes », déclare le docteur Moore.“Mon équipe a planifié un projet de recherché sur trois ans en collaboration avec Semex de manière à appliquer ces nouvelles informations dans l'industrie. L’objectif ultime est d’assister les agriculteurs à améliorer leur production, la santé de leurs animaux et la qualité de leur lait. »
Largement considéré comme l’un des plus grands taureaux de tous les temps, Goldwyn de Semex reste très haut sur les listes de l’Indice de profit à vie (IPV) et de l’Indice de la performance totale (TPI). Les producteurs laitiers du monde entier profitent non seulement de ses dizaines de milliers de filles, mais aussi de ses fils qui sont maintenant disponibles partout.
Le docteur Jacques Chesnais, généticien principale pour L’Alliance Semex ajoute que « le Séquençage est particulièrement important dans l’industrie des bovins laitiers parce que les gènes de Goldwyn contribueront beaucoup à la constitution génétique des générations futures, et plus nous en savons sur le génome de Goldwyn, mieux nous pourrons viser l’amélioration génétique pour sa descendance. »
Ces recherches sur le séquençage place l'Alberta et le Canada aux rangs des meilleurs du monde dans le domaine de la génomique de bétail. C'est grâce à la contribution de Life Technologies que ce projet a été possible.
